Основные структурные принципы разработки и проектирования основных образовательных программ ТПУ:

1. Обучение студентов по ООП подготовки бакалавров, магистров и специалистов осуществляется в ТПУ по направлениям и специальностям ФГОС, закрепленным за соответствующими научно-образовательными институтами (факультетами).
2. Приказом ректора назначаются руководители ООП по каждому уровню, направлению и специальности, а также ответственные за профили и специализации в рамках соответствующих направлений и специальностей.
3. Требования к разработке и проектированию основаны на утвержденной Ученым советом ТПУ структуре уровневых образовательных программ.
4. Программы подготовки бакалавров, магистров и специалистов в ТПУ группируются по кластерам направлений и специальностей на основе, выявленной в результате анализа ФГОС общности требований к естественно-научным, математическим, гуманитарным, социально-экономическим и базовым профессиональным компетенциям выпускников.
5. Программы подготовки бакалавров, магистров и специалистов состоят из потенциально взаимозаменяемых учебных модулей, стандартизованных по количеству кредитов ECTS. Учебные модули разрабатываются подразделениями университета вне зависимости от их принадлежности к факультетам и институтам (весь образовательный ресурс университета открыт для всех подразделений). Для ООП, соответствующих одному кластеру, учебные модули унифицируются в пределах циклов. Модули образовательной программы могут состоять из одной или нескольких обязательных или элективных дисциплин, а также включать практику, НИРС, курсовые проекты, выпускную квалификационную работу (ВКР).
6. Профили и специализации обеспечиваются конкретизацией  составляющих результатов обучения, выбором соответствующих элективных модулей вариативной части базового учебного плана, тематикой курсового проектирования, научных исследований, производственной практики и выпускной квалификационной работы.